Вопрос до конца не решен!
Плагин uploadify выдает security error при закачке файлов. Проблема оказалась в кириллические домене.
Памятка: jquery.uploadify.js security error и кириллические домены
07.05.2015
Как вариант решения: можно убрать из путей (при подключении js файла, флешки и т.д.) имени домена. В целом вариант сработал, но FireFox стал выдавать IO Error.
На досуге попробую найти полноценное решение.